Esterit voidaan luokitella sen spesifisen hapon perusteella, josta ne on johdettu. Yleisimmät ovat karboksyylihappoesterit, jotka muodostuvat karboksyylihapon ja alkoholin reaktiossa-. Esimerkkejä ovat etyyliasetaatti ja metyylipropionaatti. Näiden lisäksi on olemassa epäorgaanisia happoestereitä, -kuten sulfaatteja ja fosfaatteja-, joille on merkittävää käyttöä teollisuus- ja kemian aloilla. esimerkkejä ovat dietyylisulfaatti ja trifenyylifosfaatti. Saatujen esterien ominaisuudet, sovellukset ja stabiilius vaihtelevat kyseessä olevan hapon tyypistä riippuen.
Esterit voidaan luokitella myös niiden muodostukseen käytetyn alkoholin tyypin mukaan. Jos ne muodostetaan tyydytetyistä alkoholeista, ne tuottavat tyypillisesti yksinkertaisia rasvahappoestereitä, kuten triglyseridejä; päinvastoin, jos se on muodostettu tyydyttymättömistä alkoholeista, tuloksena on tyydyttymätön esteri, kuten glyseryylioleaatti. Alkoholit, joilla on erikoisrakenteinen -kuten sykliset alkoholit tai aromaattiset alkoholit-voivat myös reagoida happojen kanssa tuottaen vastaavia syklisiä tai aromaattisia estereitä; tämän tyyppisiä estereitä käytetään usein tuoksu-, aromi- ja lääketeollisuudessa.
Rakenteensa ja käyttötarkoituksensa perusteella esterit voidaan luokitella laajasti yksinkertaisiin estereihin, kompleksisiin estereihin ja funktionaalisiin estereihin. Yksinkertaisia estereitä muodostuu yleensä monokarboksyylihapon reaktiosta monoalkoholin kanssa, ja niitä käytetään yleisesti liuottimina tai tuoksuina. Monimutkaiset esterit-kuten triglyseridit ja fosfolipidit-ovat luonnollisten lipidien olennaisia komponentteja. Funktionaaliset esterit kattavat sellaiset, jotka sisältävät tiettyjä funktionaalisia ryhmiä -kuten polyesterit-, ja niitä käytetään laajasti muovi- ja kuituteollisuudessa. Nämä erilaiset luokitusjärjestelmät helpottavat esterien ominaisuuksien ja monipuolisten sovellusten syvempää ymmärtämistä.
